在赛博朋克2077中，入侵协议是一种令人着迷的玩法，它要求玩家扮演黑客的角色，破解密码以获取信息和资源。虽然初次接触时可能会觉得困难重重，但一旦掌握技巧，便能体验到极大的乐趣和成就感。
在进行入侵协议时，玩家需要按下L1键进行扫描，针对可进战的敌人、潜在威胁以及场景物件执行入侵。部分夜之城居民的网络可能处于离线状态，此时无法上传入侵协议，玩家只能进行快速破解。一旦进入入侵协议界面，会显示出待上传的序列。例如，输入序列“55 55 BD 55”后，可以上传魔偶：冰锥。
输入序列的方式遵循横、竖、横、竖……的顺序进行选择。第一个输入的序列总是横向的。玩家可以在横排第一行的数字中选择，例如“55 1C BD BD E9”。选择第一个“55”后，第二个输入的序列将在“55”所在的那一列中选择，从剩余的数字“E9 BD 1C 55”中挑选。之后再次按横排选择，以此类推。若输入正确，玩家可以一次性上传多个序列；若输入错误，则序列将从头开始输入。
缓冲区代表了玩家可以输入的数字上限，通过更换处理器可以扩充这一限制。在破解成功后，玩家可以使用更少的RAM和上传时间执行快速破解行动。此外，一旦入侵了一个敌人，玩家便可以入侵所有连接在同一片网络的敌人。简而言之，入侵一人即可入侵一窝，通常只需入侵两次（一次敌人，一次设备）便可以端掉一个据点。
不仅限于敌人，玩家还可以扫描诸如监视摄像头、炮台等设备终端。一些终端控制着整个设施的设备，成功入侵并破解后，玩家不仅可以获得金钱、组件等资源，还可以直接操控电脑关闭摄像头或炮台。
